Juan Alfonso de Polanco (Burgos, 24 de diciembre de 1517, Roma, 20 de diciembre de 1576) fue un sacerdote jesuita español. De 1547 a 1556 fue el secretario de Ignacio de Loyola y uno de sus consejeros más cercanos. Posteriormente fue el secretario de los dos primeros superiores generales de la Compañía de Jesús después de Loyola, Diego Laínez y Francisco de Borja.